En datadriven inställning till COVID-19 i Sydney

Lördagen den 7 mars tog min fru och jag det tuffa beslutet att skjuta upp vår förlängda semester till USA. På den tiden kändes det som ett konservativt drag. När allt kommer omkring fanns det endast 435 fall i USA bekräftade vid den tiden och 73 fall bekräftades i Australien. Oavsett hur det skulle växa ut förväntade jag mig en period på några veckor för att förstå om beslutet verkligen var motiverat eller inte. Det tog mindre än en vecka för New York City att helt stänga av.

Idag är det 17 mars. Det finns 375 bekräftade fall i Australien. 171 av dem är i NSW. Vid denna tidpunkt tycker jag att det är otroligt att det finns ett antal individer som jag interagerar med som fortfarande inte tar detta på allvar.

Jag skyller inte på dem av två skäl.

  1. Medias agenda är inte korrekt rapportering. Det är att tjäna pengar baserat på intryck och klick och ingenting håller folk tillbaka mer än rädsla. Folk har rätt att vara tveksamma till mediahype.
  2. De flesta människor är involverade i sitt dagliga arbete och har inte tid att analysera coronavirusdata eftersom det kommer in varje dag. Att vara arbetslös har lämnat mig tillräckligt med tid att analysera data, läsa artiklar och diskutera med vänner (av vilka några är i medicinska samhället)

Så låt mig förklara varför jag är orolig och varför jag är kritisk till NSW-regeringen som det nu är. Men låt oss först täcka några viktiga begrepp:

Överföringshastighet Ro

Ro är infektionshastigheten om inga åtgärder för att innehålla spridningen görs. När Ro = 1 betyder det att varje person som har viruset förväntar sig att sprida det till en annan person. Den nuvarande bästa uppskattningen Ro för COVID-19 är cirka 2,5–3. I jämförelse:

  • Pandemisk influensa R0 = 1,3
  • Ebola R0 = 2
  • SARS och MERS är mindre än COVID

För att sätta detta i perspektiv, för pandemisk influensa med en R0 på 1,3, efter 10 cykler med överföring skulle du förvänta dig att 14 personer skulle bli smittade. För COVID-19, med en R0 på 2,5–3, kan du förvänta dig att 59 000 personer skulle smittas efter 10 cykler. Källa här

Dödlighet

Detta är en utvecklande situation och den tidigare bästa uppskattningen från WHO har dödsfallet på 3,4% - Det är viktigt att detta inte är samma som dödlighetsgraden.

Enligt Worldometer idag är den bästa uppgiften vi har en dödlighet på 8%. Det vill säga om alla människor som har bekräftats ha COVID-19 och hade ett resultat, 92% av dem har återhämtat sig och 8% av dem har dött. Jag föreslår inte att detta är den exakta dödlighetsgraden av sjukdomen eftersom vissa människor är asymptomatiska och många som har den kommer aldrig att testas. Men det är ett antal som är värt att tänka på för dem som vill avfärda dödligheten i sjukdomen som försumbar.

Asymptomatiska individer och inkubationsperiod

Ovanstående förvärras av det faktum att inkubationsperioden sträcker sig från 2 till 14 dagar. Den genomsnittliga inkubationsperioden är cirka 5 dagar. 97% av människor utvecklar symtom inom 11,5 dagar. (Källa här) Detta innebär att människor går på sitt dagliga liv och besöker släktingar, går på jobbet, går på kollektivtrafik osv. Omedvetet överför allvarlig sjukdom. Det betyder också att de verkliga ärenden som rapporteras idag är 11,5 dagar efter det rätta fallet eftersom de som inkuberar en sjukdom inte har testats och bekräftats ännu. Detta är exceptionellt dåliga nyheter för "vänta och se" -ledarskap eftersom alla åtgärder som regeringen vidtar idag för att förhindra överföring har ingen märkbar påverkan på antalet fall under 11,5 dagar. I själva verket är 11,5 dagar förmodligen konservativa. Genom att granska Kinas siffror tog det nästan tre veckor för siffrorna att sakta efter att de införde lock i Wuhan. Det är också viktigt att notera att Kina hade 830 bekräftade fall när de beslutade att stänga av. Ett nummer som inte verkar så stort men de gick från 830 till 58761 på bara 20 dagar. Italien gick från 70 till 2000 bekräftade fall på bara nio dagar.

Hospitalisering och återhämtning

Många tänker fortfarande på detta som influensa eller förkylning. En av farorna är att vissa människor avgås från det faktum att de kan få det och de kommer att ha det bra. Även om det i de flesta fall är sant är det viktigt att notera att 20% av de smittade människor kommer att behöva sjukhusvistelse. 1 av 5 personer är mycket för en mycket smittsam sjukdom utan behandling. Dessutom bör alternativen inte ses som binära. Om du lider av akut lunginflammation kan du överleva COVID-19 men du kan sitta kvar med andra komplikationer som lungfibros. Detta tillstånd lämnar dig inte när du har återhämtat dig från viruset och påverkar livskvaliteten.

Behandling och vårdkapacitet

Det finns ingen effektiv behandling eller vaccin mot viruset. Om din lunginflammation blir så dålig att du inte längre kan andas utan assistans, kan sjukhus hålla dig andas med en ventilator medan kroppen återhämtar sig.

Varje land har ett begränsat antal sjukhussängar. Endast en undergrupp av sjukhussängar kan vårdas under intensivvård och det finns bara ett visst antal ventilatorer. Sammanfattning av problemet är att endast ett fåtal företag globalt tillverkar ventilatorer. Det är omöjligt att dra ner produktionen till de nivåer som nästan alla länder i världen kräver under de närmaste månaderna.

Pandemiska hanteringsstrategier

Det finns två huvudstrategier för att hantera ett utbrott.

  1. Släta ut kurvan - Dra ut pandemin men vidta åtgärder för att se till att antalet personer som är sjuka vid en viss tidpunkt inte överväger sjukvården. Ha åtgärder på plats så att så få människor som möjligt (inom ramen) drabbas av sjukdomen.
  2. Besättning immunitet - Acceptera att sjukdomen kommer att spridas. Se till att det bara sprider sig till människor som sannolikt kommer att överleva och endast tillräckligt med människor åt gången för att inte överväldiga sjukvården. När tillräckligt många människor har återhämtat sig från sjukdomen kommer de att ha immunitet och kan inte längre drabbas eller överföra den.

Nästa månad för NSW

375 bekräftade fall i Australien idag. 171 i NSW. Det här kanske inte låter alarmerande. Låt oss bara fokusera på NSW för nu och antar att vår tillväxttakt är densamma som i Australien.

Vi är på väg för att fördubbla vårt räknevärde var tredje dag. Det finns inga resebegränsningar just nu inom NSW. Skolor, kaféer, barer och restauranger är öppna med hundratals om inte tusentals människor som omedvetet överför sjukdom. Den korta videon nedan visar vår bana hittills (källa här)

Så här ser vår nuvarande tillväxttakt ut under de kommande veckorna för NSW om vi fortsätter på samma väg. Poängen med denna övning är inte att producera en exakt modell (den här modellen kommer definitivt att vara fel). Poängen med denna övning är att använda enkel matematik för att visa hur okontrollerbar tillväxt i Sydney ser ut på kort tid.

20 mars - 342 fall

26 mars - 1368 fall

2 april - 5472

8 april - 21888

14 april - 87552

17 april - 175104

Det är svårt att få en helt exakt siffra men man tror att det finns mellan 1000 och 2000 ICU-sängar i NSW. Sjukhus försöker desperat att höja detta men sjukvården skalas inte snabbt eller lätt. Med ett allvarligt / kritiskt fall på 5% gör detta krigstider i NSW-sjukhus någon gång i mitten till slutet av april.

Krigstider innebär att människor som annars skulle kunna behandlas lämnas att dö eftersom det inte finns tillräckligt med resurser för att behandla dem. Små resurser måste allokeras till dem med större sannolikhet för att överleva.

Mer oroande är det extremt vaga svaret från NSW hälsa på antalet ventilatorer det köpt. Svar som nedan från en artikel skriven den 14 mars gör lite för att lugna mig.

NSW Health, som har mer än 1000 ICU-sängar, avböjde att säga hur många extra ventilatorer staten köpt. En talskvinne sade att avdelningen ”planerar för en potentiell ökning av presentationer av personer med andningssjukdom” och arbetar för att ”maximera tillgängliga resurser för kritisk vård”, inklusive ”övervaka tillgänglighet för intensivvårdsbädd, bemanning och tillgänglighet av kritisk infrastruktur, till exempel ventilatorer” . Källa här

Varför säger jag er allt detta?

Medan regeringen är bekymrad över ekonomin (och de har rätt att vara) är det säkert en tid att sätta liv över försörjningen. Som Emmanuel Macron med rätta uttryckte det för det franska folket är vi "i krig" med detta virus. Tid är den största fienden. Jag skriver detta så att vi inte upplever en humanitär katastrof i vår stad. De som kan bör vidta definitiva åtgärder nu innan det är för sent. Acceptera inte denna sjukdom som en oundviklighet. Det är vetenskap, inte magi.

  • Vänta inte på att regeringen ber dig att dra dina barn ur skolan.
  • Vänta inte på att regeringen säger att du ska sluta gå till barer och restauranger (Stöd dem genom att ta ut).
  • Om du kan, stanna hemma.
  • Öva social distans.
  • Tvätta dina händer
  • Och nej, köp inte allt toalettpapper, du skitar dig inte ihjäl.